Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tle1Q62440 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tle1Q62440 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms