Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ndufa4Q62425 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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