Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tff3Q62395 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tff3Q62395 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms