Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rbm38Q62176 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbm38Q62176 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rbm38Q62176 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rbm38Q62176 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rbm38Q62176 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rbm38Q62176 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rbm38Q62176 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm38Q62176 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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