Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim27Q62158 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim27Q62158 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim27Q62158 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms