Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vsx2Q61412 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx2Q61412 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms