Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BcanQ61361 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BcanQ61361 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BcanQ61361 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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