Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vdac1Q60932 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms