Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf4Q60793 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms