Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SkiQ60698 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SkiQ60698 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms