Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brip1Q5SXJ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brip1Q5SXJ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms