Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AbrQ5SSL4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AbrQ5SSL4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms