Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam46cQ5SSF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms