Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf215Q5SPX3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf215Q5SPX3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms