Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trav8d-2Q5R1B6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trav8d-2Q5R1B6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms