Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trdv4Q5R1A3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms