Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spsb3Q571F5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spsb3Q571F5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Spsb3Q571F5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms