Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc9Q3V038 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ttc9Q3V038 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ttc9Q3V038 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ttc9Q3V038 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ttc9Q3V038 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc9Q3V038 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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