Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms