Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Eb2Q3UUV9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms