Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsg1Q3UM18 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms