Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc33Q3ULW6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc33Q3ULW6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms