Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp19Q3UJD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp19Q3UJD6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms