Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc58Q3UGP9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc58Q3UGP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms