Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5113Q3UGK8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5113Q3UGK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms