Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trip13Q3UA06 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms