Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cops9Q3U898 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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