Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q3U595 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U595 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U595 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U595 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U595 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U595 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U595 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms