Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VwceQ3U515 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms