Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U1D9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U1D9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms