Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Palb2Q3U0P1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Palb2Q3U0P1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms