Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc9Q3U0M1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc9Q3U0M1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms