Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Hbq1bQ3U0A6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hbq1bQ3U0A6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hbq1bQ3U0A6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hbq1bQ3U0A6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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