Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt2Q3TTY5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt2Q3TTY5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms