Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2f1Q3THK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms