Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stt3bQ3TDQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Stt3bQ3TDQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms