Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc162pQ0VG85 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc162pQ0VG85 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms