Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tigd2Q0VBL1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd2Q0VBL1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms