Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem52bQ0VBF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms