Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf541Q0GGX2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf541Q0GGX2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms