Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms