Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn1Q08091 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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