Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms