Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf3Q07104 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms