Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms