Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc2Q05020 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms