Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox13Q04891 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sox13Q04891 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sox13Q04891 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms