Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox10Q04888 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sox10Q04888 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox10Q04888 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox10Q04888 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox10Q04888 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox10Q04888 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox10Q04888 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms