Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarcad1Q04692 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smarcad1Q04692 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms