Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scg2Q03517 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scg2Q03517 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms